仿生记忆KLRSL/dsh-biomemory

dsh-biomemory

生物仿生记忆系统：跨会话记忆插件，像人脑一样分层记、分级审、会代谢、透明可改。

简体中文 · English

v0.7.1 · MIT License · DSH ≥ 0.1.1-rc.2（已在 0.1.2-rc.1 / 0.1.5-rc.1 / 0.1.5-rc.2 实测）· Node ≥ 22.19.0

给 DeepSeek Harness（DSH）的跨会话记忆插件：像人脑一样分层记、分级审、会代谢、透明可改。数据层为 SQLite（node:sqlite 内置、WAL 模式、零外部依赖），旧 Markdown 记忆首次启动自动迁移并保留只读备份。

功能特性

| 能力 | 说明 |
| --- | --- |
| 分层记忆 | Memory / Retrieved / Applied 三层分离——存储层、查询候选、已注入快照；检索到 ≠ 已采用，执行与否由 AI 结合上下文判断 |
| 分级审批 | 重要记忆（用户偏好/项目决策/踩坑教训）人工审批，普通事实自动写入；审批通道不可用时按 approvalFallback 降级（auto/deny） |
| 自动沉淀 | 会话结束自动注入「沉淀本轮」指令；启动自动注入冻结记忆快照（锁定与偏好最高优先级，冲突行为记忆置顶 [冲突] 标注） |
| 记忆代谢 | 半衰期衰减 + 引用巩固（用进废退）+ 冲突豁免 + 低权重归档；执行前自动备份、支持断点续跑与 dry-run 预览 |
| 深度反思 | 主题聚类 / 趋势统计 / 冲突提醒 / 遗忘建议，纯本地无 LLM，报告写入 longterm/reflections/ |
| 记忆类别 | memory_class 自动推断：user_decision / user_preference / fact / model_suggestion / model_inference（建议 ≠ 决定） |
| 来源可溯 | source_ref 记录来源，add 缺省记 session:；结构化审计五元组（时间/操作者/事件/条目/详情）全程可查 |
| 语义检索 | 本地嵌入模型 bge-small-zh-v1.5（512 维，离线）优先；TF-IDF + cosine 纯 JS 降级；exact / semantic / hybrid 三模式 |
| 透明可改 | 每条记忆可编辑/删除/回滚（删除前自动备份）；SQLite 单文件即所有数据，.db 直接用标准工具查看 |
| 零原生依赖 | node:sqlite 内置 + 纯 JS 实现，无原生模块冲突；管理 UI 五 tab「记忆工作台」，深色模式跟随 DSH 主题 |

安装

从 GitHub 安装（推荐）

需要已安装 git；--profile web 换成你的 profile 名
dsh plugin --profile web add github:KLRSL/dsh-biomemory

本地 bundle（开发 / link）

在项目目录下执行
dsh plugin --profile web add link:./dsh-biomemory

dsh plugin 会自动把安装的包登记到 profile 的 dsh.profile.bundles 并挂载补丁；安装完成后重启 DSH。

安装后验证：

1. 工具已注册 —— 在会话中直接调用（对话内模型可见）
memory action=query text="测试"

2. 数据层就绪 —— 首次启动后应出现
ls ~/.dsh/biomemory/
biomemory.db  biomemory.db-wal  biomemory.db-shm

3. 旧 Markdown 记忆自动迁移（保留只读备份，不删除）
迁移状态可通过 Web API 查看：
GET /biomemory/api/status → migration 字段

4. 管理 UI —— DSH 设置页出现「记忆工作台」五个 tab：
概览 / 知识库 / 代谢 / 反思 / 设置

快速开始

① 保存一条用户偏好（重要记忆 → 触发人工审批；审批通过后入库）
memory action=add track=user text="用户偏好：网络下载一律用国内镜像源" source="用户原话"

② 查询（hybrid = 精确 + 语义融合，默认）
memory action=query text="镜像源" mode=hybrid topK=5

③ 修复一条记忆（内容说错了，直接改文本，元数据不动）
memory action=update fp="a1b2c3" text="用户偏好：网络下载一律用国内镜像源（pip 清华 / npm npmmirror）"

④ 锁定重要条目（不参与衰减，永远进会话快照）
memory action=pin fp="a1b2c3"

⑤ 代谢 + 反思（建议跑一次看看效果；--dry-run 可以只预览）
memory action=dream dryRun=true
memory action=reflect dryRun=true

⑥ 审计（看看这段时间记忆系统发生了什么）
memory action=audit sinceDays=7
memory action=audit aggregate=true groupBy=action

⑦ 运行时也可以在对话里用 /memory 命令
/memory list
/memory query 偏好

使用指南

memory 工具（action 清单）

| action | 参数 | 说明 |
| --- | --- | --- |
| add | text（必填）, track=user\|agent, source | 保存记忆；重要条目自动请求审批，审批不可用时按 approvalFallback 降级 |
| query | text, mode=hybrid\|exact\|semantic, topK, minWeight, projectId, fragmentTypes, includeArchived | 查询；命中自动巩固（用进废退） |
| update | fp, text | 编辑一条记忆（保留锁定/权重等元数据；文本变了向量置空重算；审计 UPDATE） |
| remove | fp | 删除一条（删除前自动备份数据库，可回滚） |
| restore | fp | 从最近备份回滚被删除的一条 |
| list | topK | 列出全部条目；与偏好冲突的行为记忆置顶并标注 |
| pin / unpin | fp | 锁定/解锁。锁定 = 不遗忘（防衰减/归档），不代表每轮必须执行 |
| dream | dryRun, resume（默认 true） | 记忆代谢：衰减/巩固/冲突/归档；支持断点续跑 |
| reflect | dryRun | 深度反思：主题聚类/趋势统计/冲突提醒/遗忘建议 |
| audit | type, sinceDays, aggregate, groupBy（action\|day\|entry） | 结构化审计查询/聚合统计 |

示例：

memory action=add track=user text="正式名「大肥鱼」，不用旧名" source="用户原话"
memory action=query text="UI 渲染宽度规则" mode=hybrid topK=10 minWeight=0.1 fragmentTypes=decision,preference
memory action=audit type="DECAY" sinceDays=7
memory action=audit aggregate=true groupBy=day

记忆类别（自动推断，写入时记录）：user_decision（用户明确决定）· user_preference（用户偏好）· fact（普通事实）· model_suggestion（模型建议）· model_inference（模型推测）。建议 ≠ 决定，模型建议永不冒充用户拍板。

memory_recall 工具

跨会话召回（「你还记得…吗」场景），与 memory query 同底，语义上专用于回忆：

memory_recall text="去年定下的版本规则"

/memory 命令族

| 命令 | 说明 |
| --- | --- |
| /memory list | 列出全部条目（冲突条目置顶） |
| /memory query  | 关键词 + 语义检索 |
| /memory add  | 直接写入（人类发起，免审批） |
| /memory edit   | 编辑一条 |
| /memory remove  | 删除一条（可回滚） |
| /memory undo  | 回滚被删除的一条 |
| /memory pin  / unpin  | 锁定 / 解锁 |
| /memory entries [词] | 列出条目（可带过滤词） |
| /memory dream [--dry-run] | 记忆代谢 |
| /memory reflect [--dry-run] | 深度反思 |
| /memory audit [--since 7d] [--type DECAY] | 审计查询 |

冻结快照注入

会话启动时，插件自动把高价值记忆冻结注入 system prompt（注册即冻结，快照标记「会话冻结」）：

- 头部明确三层概念：本快照 = Applied Context（已注入 prompt）；Memory（存储层）与 Retrieved（查询候选）不在此列；检索到 ≠ 已采用。
- 注入顺序：锁定记忆（最高优先级，不参与衰减）→ 用户偏好（最高优先级，写入须尊重）→ 近期知识 → 近期行为。
- 与偏好冲突的行为记忆置顶并标注 [冲突]，由你裁决修改。
- 热区 token 预算 hotTokenLimit（默认 5000），超出时保留偏好与锁定段。

分级审批门

| 记忆类型 | 审批方式 |
| --- | --- |
| 用户偏好 / 项目决策 / 踩坑教训（track=user 或命中重要词） | 人工审批（ask） |
| 普通事实 | 自动写入（auto） |
| 审批通道不可用（策略 never / 服务缺失） | 按 approvalFallback：auto = 自动保存并审计降级标记 · deny = 拒绝写入（fail-closed） |

记忆代谢（Dream）

相当于睡眠时大脑做的事——/memory dream 或 memory action=dream：

1. 半衰期衰减（默认 7 天）：w × 0.5^(年龄/半衰期)，下限 1。
2. 引用巩固：单条命中引用 ≥ consolidateThreshold（默认 3）次则 +1 权重，上限 weightCap（默认 20）。
3. 冲突豁免：与偏好冲突的行为记忆不衰减不归档、保持活跃，在列表与快照中置顶浮出，由你人工裁决（编辑改掉冲突内容后恢复正常代谢），记 CONFLICT 事件。
4. 低权重归档：权重低于 decayThreshold（默认 3）→ status=archived，移动不删除。

执行前自动备份数据库（保留最近 7 次，ROLLBACK 事件可溯）；每 100 条写检查点，中断后 resume=true 断点续跑；--dry-run 只预览不落盘。

深度反思（Reflect）

纯本地、无 LLM 的周期总结：主题聚类（TF 向量余弦相似度 ≥ 0.25）· 趋势统计（近 7 天 vs 上一周写入量）· 冲突提醒（行为与偏好潜在冲突清单）· 遗忘建议（低权重候选）。报告写入 longterm/reflections/.md，支持 --dry-run 预览。

知识库（管理 UI）

DSH 设置页「记忆工作台」五个 tab：

| tab | 功能 |
| --- | --- |
| 概览 | 存储统计（条目/锁定/分层/向量数/审计近 7 天）、模型状态、迁移状态、冲突与低权重速览 |
| 知识库 | 全文/语义搜索（exact/semantic/hybrid）、按分层筛选、权重/引用/时间/锁定状态展示；一键锁定/解锁、就地编辑、安全删除（先备份可回滚）；冲突条目置顶 + 红色徽标 |
| 代谢 | 一键执行 / 预览记忆代谢，展示衰减/巩固/冲突/归档结果 |
| 反思 | 一键执行 / 预览深度反思，报告罗列与冲突就地裁决（编辑或删除） |
| 设置 | 全部配置项可视化编辑（含恢复默认） |

审计
双通道：SQLite audit_log 表（结构化，五元组 t / actor / action / entry_id / detail，主通道）+ audit.log（人类可读一行摘要，向后兼容）。

事件类型：WRITE / DECAY / CONSOLIDATE / CONFLICT / ARCHIVE / RECALL / ROLLBACK / AUTO-DREAM / AUTO-REFLECT（其余辅助事件：PIN / UNPIN / UPDATE / REMOVE / RESTORE / MIGRATE / VECTORIZE / PREVIEW / REFLECT / CONFIG）。

/memory audit                      # 最近事件
/memory audit --since 7d           # 最近 7 天
/memory audit --type DECAY         # 只看 DECAY
memory action=audit type="DECAY" sinceDays=7
memory action=audit aggregate=true groupBy=action   # 聚合统计

语义检索

先关键词匹配；命中不足时用纯 JS 的 TF-IDF + cosine 补充召回（无原生模块、完全离线）。配置了本地嵌入模型（bge-small-zh-v1.5，512 维，存储于 ~/.dsh/models/）且可用时，自动升级为 hybrid 融合检索（RRF 变体）；模型缺失/加载失败自动降级为关键词检索，记忆功能不受影响。语义命中在输出中标注「语义」。

配置

| key | 默认值 | 说明 |
| --- | --- | --- |
| halfLifeDays | 7 | 半衰期（天）：权重每过半衰期衰减一半 |
| decayThreshold | 3 | 权重低于此值 → 归档（移动，不删除） |
| consolidateThreshold | 3 | 引用 ≥ 此次数 → 巩固（+1 权重） |
| weightCap | 20 | 巩固权重上限（防膨胀） |
| hotTokenLimit | 5000 | 快照注入热区 token 上限 |
| maxQueryResults | 20 | 查询返回上限 |
| approvalFallback | auto | 审批不可用时：auto=自动保存并审计降级 / deny=拒绝写入 |
| autoDreamDays | 7 | 启动时距上次代谢 ≥ 此天数自动执行（0=关闭） |
| autoReflectDays | 3 | 启动时距上次反思 ≥ 此天数自动执行（0=关闭） |
| conflictOverlap | 3 | 冲突检测：行为与单条偏好的专有双字重叠阈值 |
| petEndpoint | null | 可选：本地桌宠通知服务 URL（默认关闭） |

可在设置页「设置」tab 可视化修改，或通过 POST /biomemory/api/config 调整；持久化为 biomemory.config.json（透明可改）。

集成

Web API（DshWebServer 注册，prefix /biomemory/api）

| 方法 / 路径 | 说明 |
| --- | --- |
| GET /status | 存储统计 + 配置 + 模型/迁移状态 |
| GET /config · POST /config | 读取 / 更新配置（白名单字段，reset:true 恢复默认） |
| POST /dream | 记忆代谢（body { "dryRun": true }） |
| POST /reflect | 深度反思（body { "dryRun": true }） |
| GET /entries | 条目列表（q 搜索词 / layer 分层 / mode 检索模式 / limit 上限） |
| POST /entries/pin · /unpin · /remove · /restore · /update | 条目管理（body 含 fp 等） |
| POST /vectors · GET /vectors | 触发向量化 / 查询向量化状态 |
| GET /audit · GET /audit/aggregate | 审计查询（sinceDays/type）/ 聚合统计（groupBy） |

通知（可选）

配置 petEndpoint 后，记忆保存等事件通过 HTTP POST 通知本地桌宠气泡（离线静默失败，不影响记忆本体）。

环境变量

| 变量 | 默认值 | 说明 |
| --- | --- | --- |
| DSH_BIOMEMORY_DIR | ~/.dsh/biomemory | SQLite 数据目录 |
| DSH_MEMORY_ROOT | ~/.dsh/memory | 旧 Markdown 根目录（迁移源与只读备份） |
| DSH_MODELS_ROOT | ~/.dsh/models | 本地嵌入模型目录 |
| DSH_MEMORY_DEBUG | — | 1 时输出调试日志 |

兼容性

- Node ≥ 22.19.0（node:sqlite 内置要求）。
- 运行时：@deepseek-ai/dsh- ≥ 0.1.1-rc.2（当前 latest 线；0.1.2-rc.1 与 0.1.5-rc.1 均已实测，按实际 lib 源码核对实现）。
- peerDependencies：@deepseek-ai/cordis ^4.0.2、@deepseek-ai/dsh-session >= 0.1.1-rc.2、@deepseek-ai/dsh-tools >= 0.1.1-rc.2。
- 预发布版本号不受 semver 范围约束：按 semver 预发布规则，范围 >=0.1.1-rc.2 的 node-semver satisfies 判定为 false（不接受 0.1.5-rc.1 这类预发布版本）。这两个包由宿主运行时必定提供，故范围仅作参考、已写入 peerDependenciesMeta 标注 optional: true（不因范围判定而阻断加载）。已实测 0.1.5-rc.1 正常加载运行。
- 零原生 npm 依赖：数据层为 node:sqlite 内置 + 纯 JS，不会与其他插件的原生模块冲突；语义检索模型为可选离线组件，缺失自动降级。
- v0.6.3 起 memory 工具返回值兼容 dsh-tools 新版 lossless JSON 校验（undefined/NaN 字段统一置 null，避免工具校验报错）。

版本历史

| 版本 | 日期 | 要点 |
| --- | --- | --- |
| v0.7.1 | 2026-09-17 | 审批门修复（真缺陷）：gateWrite 调 approval.request() 时只传了 toolName/reason——而官方实现（dsh-user-approval 0.1.5-rc.2 源码第一行）就取 req.agent.session，于是 req.agent 为 undefined → 抛 Cannot read properties of undefined (reading 'session')，所有重要写入（用户偏好/项目决策/教训）一律失败（实测连撞两次）。修法照抄官方 dsh-tools 的调用形态 { agent, toolName, callId, reason, signal }，并补「缺 agent → fail-closed 兜底 + 审计 no-agent」而不是崩（官方对无 agent 同样是返回 deny，不是抛）。新增 2 例：载荷透传 agent/callId、缺 agent 不崩且记审计；79 测试全绿 |
| v0.7.0 | 2026-09-17 | 镜像同步挂载：新增 mirror.mjs——dream / reflect 结束后（工具 memory action=dream、/memory dream、启动自动代谢、设置页 POST /dream 四条路径）异步触发外部维护脚本 E:\DE\tools\bm-sync-mirror.cjs，把 SQLite 重新导出为人类可读镜像（/preferences.md + longterm\条目镜像.md）。为什么由外部脚本做：v0.6.4 单轨制的核心就是「SQLite 唯一事实源、插件不写 Markdown」，若在写入路径恢复 Markdown 写入等于退回双轨（正是 8/20~9/5 那 79 条从未注入的根因）——所以插件只负责触发，生成与备份全留在外部脚本。行为：--dry-run 不同步、DSH_BIOMEMORY_MIRROR_SYNC=0 可关闭、DSH_BIOMEMORY_MIRROR_SCRIPT 可换脚本；脚本缺失/失败/超时（15s）都不影响记忆本体，只留一行调试日志；脚本路径惰性求值（模块顶层固化会让「先 import 后设环境变量」的覆盖失效，与 db.mjs::biomemoryDir() 同一教训）。另：镜像脚本改为原子写（临时文件 + rename），避免中断留下半个镜像。★实现上踩掉两个坑：①脚本路径必须惰性求值（模块顶层固化会让「先 import 后设环境变量」的覆盖失效，与 db.mjs::biomemoryDir() 同一教训）；②不能对子进程调 unref()——实测 detached + unref 会让父进程收不到 exit/close 事件，Promise 永不 settle、调用方 await 悬挂（改用 close 事件且不 unref）。新增用例覆盖触发/环境变量透传/关闭开关/脚本缺失；77 测试全绿（连跑 3 次稳定） |
| v0.6.8 | 2026-09-17 | 审计双写修复：store.mjs 原先 8 处、retrieve.mjs 1 处直接调用 db.audit（只写 SQLite 的 audit_log 表），而人类可读镜像 /audit.log 的追加逻辑在 shared.mjs::audit 里——于是自 v0.5 起，经 memory 工具写入/编辑/删除/钉选的记忆全都不进镜像（实查镜像里 WRITE 行止于 2026-08-19，只剩 DECAY / CONSOLIDATE 等代谢事件），与文档「SQLite audit_log 表 + 人类可读镜像」的说法不符。现统一走 shared.audit，并把 fp / 文本摘要提到顶层载荷（对齐 meta.mjs 既有约定），镜像行恢复为 [时间] ACTION fp 摘要；新增回归用例锁死该行为；76 测试全绿 |
| v0.6.7 | 2026-09-17 | 备份文件唯一性兜底：backupDb() 的时间戳只有毫秒精度，同一毫秒内连续备份会撞名并静默覆盖上一份（「每次备份独立文件」用例偶发失败即此因）——现在撞名自动追加 -2 / -3 序号后缀，每次备份必定独立成文件；对应用例改为紧密循环连续备份（同毫秒内 3 次也必须互不撞名且文件都存在）；75 测试全绿 |
| v0.6.6 | 2026-09-17 | exact 排序语义修正：由「按 weight 排序」改为「按相关度排序 + weight 有界加成」——score = relevance × (1 + 0.5·min(weight, weightCap)/weightCap)，relevance = Σ 命中字段权重（正文 1.0 / 摘要 0.5 / 实体 0.25）+ 0.1·min(命中次数, 5) ∈ [0, 2.25]；weight 最多把分数抬高 50%（与 hybrid 的 γ 项同构、同用 weightCap 归一），因此低 weight 但更相关的条目不再被高 weight 擦边命中者压后，用户锁定的重要记忆在同分/近似分时仍有优势；同分时按 weight 降序 → created_at 降序 → entry_id 升序收敛（全序、确定性，同输入同输出）；空查询（list/浏览）保持 weight 降序与冲突置顶不变；queryEntries 返回结构、命中自动巩固（hits+1）、search/queryEntries 参数与 hybrid 的 RRF 融合（只取 exact 的 rank）均不变；新增 6 个用例（75 测试全绿） |
| v0.6.5 | 2026-09-16 | 缺陷修复与安全加固：审批门 fail-closed（默认审批缺失/异常/非授予 → 拒绝写入并记审计，原默认 auto 会静默免审批；接受运行时全部授予词）；hybrid 融合 γ·(weight/weightCap) 归一到 RRF 同量级（原 γ·weight 淹没语义排名）；快照预算修正（偏好/锁定逐条截断 + kb/bb 保底，注入不再超 hotTokenLimit）；反思冲突判别改 kind==='行为'（新写入行为记忆此前永远进不了潜在冲突）；/memory audit 与 GET /entries 字段对齐（audit 不再输出 undefined、entries 补 hits/pinned/mode/ts/kind 且 q 分支应用 layer）；UI 主题跟随加 MutationObserver、副标题动态取数、操作失败不再静默；peerDependenciesMeta 适配预发布范围 |
| v0.6.4 | 2026-09-06 | 数据层单轨制：SQLite 为唯一运行时数据源——写入一律走 memory 工具（writeEntry 不再追加 preferences.md）；偏好文本/冲突检测改从 SQLite 读（prefsText()，替代读 Markdown）；Markdown（hot/projects/longterm/preferences）永久降级为只读备份+人工查看层，不再参与运行时读写（消除「双轨不同步」盲区）；60 测试全绿 |
| v0.6.3 | 2026-09-05 | 适配 DSH 0.1.2-rc.1：memory 工具返回值兼容 dsh-tools 新版 lossless JSON 校验（undefined/NaN 字段置 null，修复工具报错）；插件 UI 深色适配（DSH 主题跟随，双通道探测 + MutationObserver） |
| v0.6.2 | 2026-09-05 | 管理 UI 按「骨架/血肉/呼吸」设计语言重构：现代极简——neutralSurface 底 + 白色圆角卡片分层、主色下划线 tabs、4/8px 栅格、150ms 动效；配色全部取自 dsh-fuse design 令牌，零硬编码；确立紫粉品牌色（记忆神经） |
| v0.6.1 | 2026-09-05 | Memory / Retrieved / Applied 三层分离（检索到 ≠ 已采用）；记忆钉语义修正（锁定 = 不遗忘 + relevance admission）；记忆类别 memory_class + 来源 source_ref；schema 演进（entries 表新增列，旧库启动自动 ALTER，幂等） |
| v0.6.0 | 2026-08-31 | index.mjs 拆为 shared / store / retrieve / meta / snapshot / gate / notify / session-state 模块（行为不变，57 测试全绿）；会话结束自动沉淀（turn/end 后注入总结指令，写即清标记、5 分钟防呆、严格去重） |
| v0.5.3 | 2026-08-31 | 设置页改用 dsh-fuse 设计令牌；peerDeps 升至 >=0.1.1-rc.1 |
| v0.5.2 | 2026-08-20 | 可编辑记忆（update 保留锁定/权重，审计 UPDATE，防重复）+ 冲突浮出置顶（行为与偏好冲突不再静默降权）+ 单条回滚（restore / /memory undo） |
| v0.5.0 | 2026-08-20 | SQLite 数据层（~/.dsh/biomemory/biomemory.db，node:sqlite 内置、WAL、零外部依赖）+ 本地嵌入语义检索（bge-small-zh-v1.5，512 维，离线）；旧 Markdown 记忆自动迁移（保留只读备份）+ 审计聚合 + dream 断点续跑 |
| v0.4.0 | — | 自动召回（命中巩固，用进废退）/ 自动保存（审批降级 + 自动代谢/反思周期）+ 深度反思 + 知识页（设置页 tab） |
| v0.3.x | — | 记忆代谢（dream）+ 记忆钉（pin）+ 结构化审计（audit.jsonl）+ 语义检索（TF-IDF）+ 设置面板 |

常见问题

- Node 版本：要求 Node ≥ 22.19.0（node:sqlite 内置）；旧版本可能无法加载插件。
- DSH 运行时兼容性：目标 @deepseek-ai/dsh- ≥ 0.1.1-rc.2——请核对实际运行的运行时版本（0.1.2-rc.1 与 0.1.5-rc.1 均已实测）。注意 semver 预发布规则：>=0.1.1-rc.2 不会 satisfies 0.1.5-rc.1，但这两个包由宿主提供，加载不受影响（见「兼容性」）。
- 工具报错（Invalid object / lossless JSON）：升级到 v0.6.3+，返回值已兼容 dsh-tools 新版严格校验。
- 重要记忆写不进/被拒：v0.6.5 起审批门默认 fail-closed——审批服务缺失、approval.request 抛错或返回非授予值（rejected/cancelled/unavailable）都会拒绝写入并记 APPROVAL-UNAVAILABLE 审计。若想沿用旧的自动保存行为，在设置页或 biomemory.config.json 显式设置 approvalFallback: "auto"。
- 审计/知识库列表出现 undefined：已在 v0.6.5 修复（/memory audit 字段对齐 action/entry_id/detail；GET /entries 补 hits/pinned/mode/ts/kind，带 q 时也应用 layer 筛选）。
- 语义检索不可用：检查 ~/.dsh/models/bge-small-zh-v1.5 模型是否存在；缺失时自动降级为关键词 + TF-IDF 检索，记忆功能不受影响。
- 记忆写入失败：检查 ~/.dsh/biomemory/（及 DSH_BIOMEMORY_DIR）读写权限；审批被拒时确认审批策略与 approvalFallback 设置。
- 旧 Markdown 记忆去哪了：首次启动已自动迁移进 SQLite；E:\DE\memory\ 保留为只读备份（v0.6.4 起为纯只读层，不再写入/读取，修改它不会影响运行时——写入一律走 memory 工具）。

数据层（单轨）
- 唯一数据源：~/.dsh/biomemory/biomemory.db（SQLite，node:sqlite 内置、WAL）。
- 只读镜像：E:\DE\memory\（hot/ projects/ longterm/ preferences.md）仅备份与人工查看，v0.6.4 起不参与运行时——手工编辑不会生效。
- 写入入口：memory 工具（add/edit/remove/pin）与 /memory 命令，全部落 SQLite 并审计。
- 一次性迁移：新环境首次启动仍会从 Markdown 导入历史（meta.migrated_at 幂等，仅一次）。
- 误删的条目还能找回吗：删除前自动备份数据库（保留最近 7 次），/memory undo  或 memory action=restore fp=... 即可恢复。
- 原生模块冲突：本插件无任何原生依赖——纯 JS 实现，不会与其他插件冲突。

开发

运行测试（node:test，69 个用例全绿）
npm test

发布一致性自检（版本号 / README 版本露出 / files 白名单 / lock / git 状态）
node scripts/release-check.mjs

CI：.github/workflows/ci.yml 在 Node 24 上执行「安装依赖 → 发布自检 → 单元测试 → npm pack --dry-run」，推送与 PR 都会触发。

模块结构：index.mjs（接线层）+ shared（配置/审计/冲突）· store（写入/钉/删/回滚/迁移）· retrieve（查询/语义）· meta（代谢/反思）· snapshot（快照/会话沉淀）· gate（审批/自检）· notify（桌宠通知）· session-state · db（SQLite 数据层）· embed（嵌入模型）。

贡献：fork → 修改 → 补充/更新测试 → 提交前运行 npm test；报 issue 请附 DSH 运行时版本、Node 版本与复现步骤。

License

MIT — 完整文本见 LICENSE。