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未验证
一个可复现、AI 辅助的流水线，将论文列表转化为癌症系统综述 / meta 分析可直接发表的
尚未跑自动兼容性验证，可查看页面内的依赖与入口分析。 · 最近上游提交 2026/9/25 · 已提供中文文档
AI辅助、可复现的流程，将论文列表转化为可用于发表的提取表格，用于癌症系统综述
综合分
30.8
GitHub 分
30.8
用户评分
—
★ Stars
1
周下载量
—
安装插件（需先安装 dsh CLI 引擎：npm install -g @deepseek-ai/dsh）
dsh plugin --profile web add ReGMeIoN/cancer-meta-pipeline该插件未发布到 npm，走 GitHub 源安装（pnpm 若拦截 prepare 脚本，按其提示在 pnpm-workspace.yaml 的 allowBuilds 中放行后重跑）
信任档位：已验证本站已于 1 天前真实安装成功
- 是什么
- dsh 原生插件 · chat
- 装得上吗
- 本站已真实安装成功（非静态推断）
- 安全吗
- 本站尚未对该插件做风险分级（暂未覆盖，不等同于无风险）
- 还在维护吗
- 活跃：最近一次提交在 1 天前
档位由下列信号合成：本站实装验证（真实安装，当前最高到 L4）· 验证所用 dsh 版本 · 静态安装检查 · 风险分级 · 仓库维护状态。下方各区块是它的证据明细。 验证判据与等级说明 →
🟢实装验证通过· 2026/9/25
由本站实装验证器在真实 dsh 环境安装成功，非静态推断。
数据截至 2026/9/25（元数据每日更新 · 实装验证按队列轮转，单条结论的验证时间见上方）
用户评分
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README
由 DeepSeek 最新模型翻译生成cancer-meta-pipeline 一个可复现、AI 辅助的流水线，将论文列表转化为癌症系统综述 / meta 分析可直接发表的 提取表格。 给它三样东西——一份论文列表、一份用平实语言撰写的筛选方案，以及一个 abstrackr 项目 id——它就会运行整个文献 工作流：规范化 → 去重 → 编译机器可读的评分标准 → 分批进行标题/摘要 筛选 → 将决定写回平台 → 全文追踪 → 数据 提取 → 表 1 / 表 2。 它以 DeepSeek Harness Skill 的形式发布：一个 SKILL.md 加上纯 Python 脚本。没有框架、没有数据库、没有需要运行的服务。 它做什么（8 个阶段，每个阶段都设有人工检查点） | # | 阶段 | 输出 | |---|---|---| | 1 | 摄取 — CSV / Excel / RIS / BibTeX / EndNote / 纯 PMID 列表 | work/records_local.csv + 导入报告 | | 2 | 拉取平台 — 带 citation_id、状态、标签的完整导出 | work/records_all.csv、状态快照 | | 3 | 编译评分标准 — 平实语言方案 → E-code 表 + 纳入条款 | work/_compiled/rubric.json、PROMPT_batch.md、PROMPT_fulltext.md | | 4 | 批量筛选 — LLM 子代理以 250 条记录为一批评判标题/摘要 | work/batches/ → work/decisions/ | | 5 | 验证与合并 — 一个中央验证器，绝不自行编写检查 | work/validation_report.md、screening_decisions.csv | | 6 | 提交 — 先试运行，审计标签，回滚路径 | 平台标签 + logs/submit_audit.log | | 7 | 全文 — 三通道开放获取追踪（Europe PMC / Unpaywall / PMC） | article/oa/.txt、需人工处理列表 | | 8 | 提取 — 表 1（特征 + 报告效应）、表 2（效应量） | out/table1_、out/table2_、.docx、coverage_audit.md | 每个阶段都以一个检查点结束：该 skill 会停下来，在继续之前询问审阅者。 内建的设计规则 - 每批 200–300 条记录（小批量会成倍增加子代理的启动成本）。 - 子代理不得编写自己的脚本或验证器——只有一个中央验证器。 - 提示词存放在文件中，因此一百个批次共享完全相同的措辞。 - 一切皆可追溯：每个决定都带有理由 + 逐字引用；每次 平台写入都会留下审计标签（ft:corrected-from-）和记录在案的回滚方案。 - E-code ⇒ excluded 在代码中强制执行：一项仅报告复合结局 （仅敏感性）的研究，或一项孟德尔随机化研究（三角测量流），永远不能 进入主要合成，即使某个子代理将其标记为“Include”。 要求 - Python 3.10+（仅标准库；PDF→文本需要 pypdf，Word 表格需要 python-docx） - 可选：用于合并步骤的 R + metafor（见 reference/HANDOFF_to_analysis.md） - 可选：用于 平台阶段，以及一个存放凭据的 ABSTRACKR_HOME 目录 快速开始 projects// ├── config.json # 平台项目 id + 批大小 ├── protocol.md # 你的 PECO + 纳入条款 + E-code 表（见 templates/） └── input/ # 论文列表，支持任意格式 $skill = '' $py = 'python' $env:PYTHONIOENCODING = 'utf-8' $proj = '>' & $py "$skill\scripts\ingest.py" --project $proj & $py "$skill\scripts\pull_platform.py" --project $proj & $py "$skill\scripts\compile_rubric.py" --project $proj # ⛳ confirm the E-code table & $py "$skill\scripts\prep_batches.py" --project $proj --size 250 ... one subagent per batch, using work/_compiled/PROMPT_batch.md ... & $py "$skill\scripts\validate_decisions.py" --project $proj & $py "$skill\scripts\merge_decisions.py" --project $proj & $py "$skill\scripts\submit_decisions.py" --project $proj # dry-run, then --execute & $py "$skill\scripts\verify_write.py" --project $proj & $py "$skill\scripts\build_tables.py" --project $proj --audit 离线冒烟测试（虚构数据，无网络，无平台）： & $py "$skill\scripts\ingest.py" --project "$skill\examples\smoke" & $py "$skill\scripts\compile_rubric.py" --project "$skill\examples\smoke" & $py "$skill\scripts\prep_batches.py" --project "$skill\examples\smoke" --size 2 & $py "$skill\scripts\build_tables.py" --project "$skill\examples\smoke" --audit 目录结构 SKILL.md 入口点：阶段、硬性规则、检查点 stages/DETAILS.md 分步操作说明 scripts/ 13 个脚本，每个阶段一个（+ common.py） templates/ protocol / rubric / prompt / config / handover 模板 reference/PITFALLS.md 26 个真实陷阱（运行任何东西之前先读这个） reference/checklist.md 每个阶段的交付物和要问的问题 examples/ 虚构的冒烟项目（CSV / RIS / BibTeX） 先读这个 reference/PITFALLS.md 是这里最有价值的文件——每一条都是来自真实评审的真实失败案例（平台限流、被静默截断的快照、BOM 损坏的 JSON、一个大小写敏感的正则悄悄禁用了核心规则、metafor 的 I² 本身已经是百分比，等等）。 许可证 尚未选定——在生产环境中依赖它之前，请先添加一个。