细胞系检索 xby-skill/xby-cellosaurus

xby-cellosaurus

DeepSeek Harness (DSH) 的插件：细胞系知识资源服务

Cellosaurus MCP Server 是一个非官方的模型上下文协议服务器，用于访问 SIB Cellosaurus 细胞系知识资源，提供细胞系搜索、详细信息获取和数据库版本信息等功能。

功能

- set_xby_apikey — 在聊天中设置 API 密钥（自动持久化，重启有效）
- search_cell_lines — 在 Cellosaurus 数据库中搜索细胞系。

使用 Solr 搜索语法按各种条件查找细胞系。

示例

- 基本名称搜索："id:HeLa" 或 "sy:HeLa"
- 物种筛选："ox:human" 或 "ox:9606"
- 疾病筛选："di:cancer" 或 "di:hepatoblastoma"
- 组合筛选："ox:human di:cancer ca:cancer"
- 位点筛选："derived-from-site:liver"

参数： query：使用 Solr 语法的搜索查询（默认："id:HeLa"）
fields：要返回的字段列表（例如 ["id", "ac", "ox", "di"]）
start：分页的起始索引（默认：0） rows：要返回的结果数量（默认：10，最大：1000） sort_order：排序顺序（例如 "group asc,derived-from-site desc"）

返回

包含搜索结果及细胞系信息的字典
- get_cell_line_info — 通过登录号获取特定细胞系的详细信息。

参数： accession：细胞系登录号（例如 HeLa 的 "CVCL_0030"）
fields：要返回的特定字段列表（例如 ["id", "ac", "str", "di"]）

返回

包含详细细胞系信息的字典
- get_release_info — 获取当前 Cellosaurus 数据库版本的信息。

返回

包含版本号、日期和统计信息的字典
- find_cell_lines_by_disease — 查找源自特定疾病患者的细胞系。

参数： disease：疾病名称或术语（例如 "hepatoblastoma"、"cancer"、"leukemia"） species：物种筛选（默认："human"，可以是 "mouse"、"rat" 等） fields：要返回的特定字段 limit：最大结果数量（默认：10）

返回

包含与该疾病相关细胞系的字典
- find_cell_lines_by_tissue — 查找源自特定组织或器官的细胞系。

参数： tissue：组织/器官名称（例如 "liver"、"lung"、"breast"、"brain"） species：物种筛选（默认："human"） fields：要返回的特定字段 limit：最大结果数量（默认：10）

返回

包含来自指定组织的细胞系的字典
- list_available_fields — 获取可从 Cellosaurus API 请求的所有可用字段的列表。

返回

字段名称到其描述的映射字典

安装

方式一：从 GitHub 直接安装（推荐）

格式: dsh plugin --profile add github:/
dsh plugin --profile web add github:xby_skill/xby-cellosaurus

方式二：从本地目录安装（开发模式）

仅用于本地开发调试
dsh plugin --profile web add /absolute/path/to/xby-cellosaurus

方式三：通过 cordis.patch.yml 开发调试

dsh web --profile web --patch /absolute/path/to/dsh-ocr-plugin/cordis.patch.yml

配置

获取 API 密钥

前往 小笨羊官网 注册并获取 API 密钥。