知识库工作台 yangdongzhen590/dsh-knj-obsidian

dsh-knj-obsidian

DSH（DeepSeek Harness）内简化版 Obsidian：为 AI agent 提供项目级知识库（wiki）的构建能力。agent 通过工具把对话、文档、网页等源材料蒸馏为结构化知识页，落盘到项目根目录的 .wiki/，形成可复用、可维护的知识资产。

当前版本为 v1 构建核心 + v2 检索 + v3 图谱导出 + v4 UI + v5 笔记编辑：写入侧（ingest / capture / lint）已完整；检索侧提供 wiki_query 工具与 wiki-query skill 双通道（见下文「v2：检索」）；图谱侧提供 wiki_export 工具导出交互图谱与结构化图数据（见下文「v3：图谱导出」）；UI 侧提供右侧边栏"知识库"标签 + 笔记/图谱工作台（见下文「v4：UI」）；v5 起笔记工作台支持富渲染、双链原地跳转、源码视图与全文编辑（见下文「v5：笔记编辑」）。

安装方式

需要 Node.js ≥ 20，且已安装 DSH 宿主（提供 dsh CLI 与 web profile）。

1. 在插件目录内打包
npm pack

2. 在插件目录内执行：安装到 DSH 的 web profile
dsh plugin --profile web add ./dsh-knj-obsidian-2026.8.257.tgz

3. 重启 DSH，确认宿主日志无 dsh-knj-obsidian 相关报错

安装后插件在 DSH 启动时自动向 agent 暴露工具（wiki_ingest / wiki_capture / wiki_lint / wiki_query / wiki_export），并随包分发 wiki-query skill，无需额外配置。

v1 能力

| 工具 | 作用 |
| wiki_ingest | 把 agent 提取好的知识页批量写入 wiki。入参 pages（id / title / category / tags / confidence / body）+ source（源材料标识）。同 id 页面自动合并正文（保留 created、更新 updated）；传入 contentHash（源内容 SHA-256）且与 manifest 记录一致时整体跳过，实现增量 ingest。 |
| wiki_capture | 把当前讨论快速沉淀为一条知识页（quick 模式，默认写入 references/，confidence=inferred），适合把对话结论即时落盘。 |
| wiki_lint | 健康度检查：孤儿页（入链或出链缺失的页面）、断链（[[wikilink]] 指向不存在页面）、缺 frontmatter。返回报告供 agent 自查或人工查看。 |

.wiki 结构

知识库位于项目根目录的 .wiki/（由 process.cwd() 决定）：

.wiki/
├── index.md # 维护的索引页 ├── .manifest.json # 源材料增量追踪（contentHash → 跳过重复 ingest） ├── _system/ # 会话归档、处理器与进度等内部运行数据（不参与知识检索） ├── concepts/ # 概念页 ├── entities/ # 实体页 ├── references/ # 参考资料 ├── synthesis/ # 综合/跨主题结论 └── projects/ # 项目知识

每页为 Markdown + YAML frontmatter：

id: kebab-case-stable-id
title: 页面标题 category: concepts
tags: [tag-a, tag-b]
source: 源材料标识 confidence: extracted|inferred|ambiguous created: 2026-08-25T00:00:00.000Z updated: 2026-08-25T00:00:00.000Z

markdown 正文（不含 frontmatter）

v2：检索

v2 检索基于同一 .wiki/ 知识库，提供双通道能力，均只读（不创建/修改任何页面）：

| 通道 | 触发方式 | 说明 |
| wiki_query 工具 | agent 自动调用 | 内置于插件，DSH 启动即暴露。agent 被问到「我之前关于 X 踩过什么坑」「我了解 Y 吗」这类既有知识问题时自动调用它检索 .wiki/，再基于候选合成带引用的回答。 |
| wiki-query skill | 独立 skill（fallback） | 随包分发的 skill（wiki-query/SKILL.md + references/retrieval-guide.md）。在工具不可用/受限的环境里，agent 按该 skill 用 grep / glob / read 完成同等分层检索（通道对齐关系见下）。 |

分层检索策略

wiki_query 与 wiki-query skill 共用同一套从便宜到贵的分层层级（L1–L4），两者对 L1 的语义对齐如下：

1. L1 — index 快速层：读 .wiki/index.md，匹配查询词所在行。工具 mode=index-only 只做这一步；skill 在 auto 模式下把 L1 当作预热扫描，命中后仍继续 L2 核对更强者（工具 auto 模式不查 index，直接从 L2 开始）。
2. L2 — 标题 + 标签层：grep 标题与 frontmatter 标签，读命中文件的 title / tags / confidence（命中即停，不升 L3）。
3. L3 — 正文层：L2 无果时打开正文定位查询词，截取上下文 ≤200 字符作为 snippet。
4. L4 — 图谱邻居：解析命中页的 [[wikilink]] 出链，取一跳邻居作为关联候选。
通道对应关系：工具 auto 模式 = L2→L3→L4；工具 mode=index-only = skill 的 L1 快速层；skill 完整流程 = 工具 auto 模式 + L1 预热扫描。两通道在相同 vault 上对同一查询给出的候选集一致（skill 按上述语义执行时，L1 在 auto 下不产生候选，与工具一致）。

答案由 agent 基于候选页合成，必须带引用（页面路径 + confidence 标记：extracted / inferred / ambiguous）。无匹配时返回「wiki 无匹配」，并建议把相关内容吸收进 wiki。

wiki_query 工具

- 入参：query（检索词，必填）、mode（auto 分层 / index-only 只查 index）、maxCandidates（默认 10）。
- 返回：candidates[]（page / id / category / title / confidence / snippet / matchedBy）+ strategy + totalPages。

wiki-query skill（无工具 fallback）

无 dsh 工具的环境里，agent 按 wiki-query/SKILL.md 的流程用 grep / glob / read 完成同等检索，降级路径（无 grep、无 index.md、结果过多）见 references/retrieval-guide.md。skill 只读，发现新知识时路由到 wiki_ingest / wiki_capture。

本地语义检索（wiki_search_semantic，进程内 QMD，严格离线）

除关键词分层检索外，插件还提供本地语义检索工具 wiki_search_semantic：在 DSH 进程内直接使用 @tobilu/qmd 库（不 spawn 命令、不走 MCP、无需单独安装或启动任何 QMD 插件），只用两条不会联网的通道——本地嵌入模型向量检索 + BM25 关键词检索——并在本地做 RRF 融合。

- 入参：query（必填）、limit（默认 8，硬上限 20）。
- 返回：status（ready / index-empty / index-stale / model-missing / library-missing）+ results[]（id / category / title / snippet / score，score 为融合分数非概率）+ 必要的 message。
- 页面引用从命中路径推导（displayPath / qmd:// URI），不使用 QMD 的 docid（它是内容哈希）；只接受七个正式分类下的 .md，_system/、_raw/、wiki-export/ 永远不会成为结果。

严格离线：@tobilu/qmd 的混合检索默认会拉起 1.7B 查询扩展模型与 0.6B 精排模型（默认值为 hf: 云端 URI，缺失时会自动下载），因此插件禁用这两条路径——把它们钉到 ~/.dsh/qmd/models/ 下不存在的本地路径，任何误用只会在本地失败。索引与查询全程零网络。

这一约束必须双写：既写进传给 createStore 的配置，也写进进程环境变量（QMD_EMBED_MODEL / QMD_GENERATE_MODEL / QMD_RERANK_MODEL）。原因是 QMD 的分块路径（chunkDocumentByTokens → getDefaultLlamaCpp() → tokenize()）走的是模块级单例，它不读 store 配置、只认环境变量与默认值——只设 config 时，单例会去解析默认的 hf: 云端模型并联网，表现为嵌入阶段无限等待（进程内存不涨、CPU 不动）。这一点已由 semantic-index.test.mjs 的「单例环境」用例锁死。

模型放置（一次性人工步骤，约 320 MB）：

目录不存在就建；插件不会自动下载，也不会联网
mkdir -Force $env:USERPROFILE\.dsh\qmd\models
把模型放到（文件名必须一致）： %USERPROFILE%\.dsh\qmd\models\embeddinggemma-300M-Q8_0.gguf 可选手动下载：https://hf-mirror.com/ggml-org/embeddinggemma-300M-GGUF/resolve/main/embeddinggemma-300M-Q8_0.gguf

模型缺失时工具如实回报未就绪（给出精确路径与文件名），并且不打开索引库（不 import 库、不建 sqlite、不留句柄）；关键词检索 wiki_query 始终可用。语义状态固定在 ~/.dsh/qmd/（models/、index.sqlite、config.yml），索引文件不进 vault。

内网 / 离线部署：@tobilu/qmd 声明为插件的 optional peerDependency（peerDependenciesMeta 标 optional）。DSH profile 默认 autoInstallPeers: false，因此 pnpm 不会自动安装它——这既保证插件本体永远装得上，也避免了它的依赖（node-llama-cpp 及其 14 个 @node-llama-cpp/ 平台包，其中 CUDA/异平台变体常有上百 MB 且在内网拉不到）在每次安装任何插件时被反复尝试下载。

要启用语义检索需显式安装一次：

dsh plugin --profile web add @tobilu/qmd@2.8.3

（该命令会连带安装 node-llama-cpp 等原生依赖；内网需先把这批包镜像进私有仓库——清单与工具在源码仓库的 tools/qmd-offline/，含 README.md、packages.json 与 mirror-qmd.mjs 的 list/pack/verify 命令，不随 npm 包分发。未安装时 wiki_search_semantic 会如实返回 library-missing 并保持关键词检索 wiki_query 完全可用。）

索引新鲜度与「更新索引」

语义索引不会凭空存在，它需要先建一次：
- 自动：wiki_ingest 落盘后会安排一次 debounce（默认 15 秒）后台刷新，连续的批量入库合并成一次；同一库同时最多一次刷新（单飞）。待嵌入积压超过阈值（默认 500 篇）时不自动跑，而是如实回报「请点更新索引」，避免一次大批入库在后台悄悄占满 CPU 很久。
- 手动：边栏「语义索引」块里的 「更新索引」 按钮 → POST /api/obsidian-wiki/semantic-update（立刻返回 202，后台执行），状态由 GET /api/obsidian-wiki/semantic-status 轮询（重建期间每 2 秒），块内显示状态、已索引篇数、待嵌入篇数、进行中已用时间与上次结果。
- 关掉自动刷新（保留手动按钮）：环境变量 KNJ_OBSIDIAN_AUTO_REFRESH=off。
- 模型未就位时状态块直接显示「模型未就位」与精确路径，按钮禁用——不会发一次注定无效的请求。

耗时预期（本机 i7-12700H + RTX 3060，实测）：

| 场景 | 实测 | 说明 |
| 真实库 7 篇 | update 44ms + embed 86.7s | 几乎全是一次性冷启动（模型加载 + 后端探测） |
| 合成 300 篇 冷启动 | update 1.7s + embed 96.2s | 冷启动成本与库大小基本无关 |
| 合成 300 篇 热态 | embed 11.9s = 0.04s/篇（25 篇/秒） | 稳态吞吐 |
| 外推（稳态） | 500 篇 ≈ 0.3 分钟，2000 篇 ≈ 1.3 分钟 | 首次另加约 1.5 分钟冷启动 |

后端差异很大（tools/bench-embed.mjs，1053 token 文本）：CPU 饱和在 51–56 token/秒，Vulkan 3125–3400 token/秒（约 60 倍）；本机 auto 会选 Vulkan，纯 CPU 机器的索引耗时应按两个数量级上调，因此务必用可见的手动入口而不是静默后台。注意 QMD_LLAMA_GPU=cuda 在离线环境不可用（会尝试 git clone llama.cpp），保持默认 auto 即可。

v3：图谱导出

v3 图谱基于同一 .wiki/ 知识库构建 wikilink 知识图谱（节点=页面、边=[[wikilink]] 链接），提供 wiki_export 工具导出，只读（不修改任何页面）。

wiki_export 工具

agent 被问到「导出 wiki 图谱」「看看知识库的结构/关联」「生成知识图谱」时自动调用它。入参 format：

| format | 产物 | 用途 |
| html（默认） | graph.html | 单文件交互可视化：内联 SVG + 原生 JS 力导向布局，零外部依赖，浏览器可直接打开 |
| json | graph.json | 结构化图数据（节点 / 边 / 孤儿 / 统计），供外部工具（Gephi / Neo4j / 自研分析）使用 |

产物写入 /wiki-export/（vault = 项目根目录 .wiki/），返回 file / nodeCount / edgeCount。

浏览器打开

导出后直接打开 .wiki/wiki-export/graph.html：

- 拖拽节点调整布局，滚轮缩放（viewBox），悬停节点显示标题与分类
- 节点按 category 着色（concepts 蓝 / entities 绿 / references 橙 / synthesis 紫 / projects 灰）
- 顶部显示 N 节点 · M 边 统计，底部为图例

graph.json 格式

{
"nodes": [ { "id": "kebab-case-id", "title": "页面标题", "category": "concepts", "confidence": "extracted" } ],
"edges": [ { "source": "a", "target": "b", "broken": false } ],
"orphanIds": ["c"],
"pageCount": 42
}

- broken: true：出链指向不存在的页面（断链）
- orphanIds：既无出链也无入链的页面（孤儿）

孤儿 / 断链在图谱中的表现

- 断链：红色虚线边，末端带红点（指向不存在的页面；仅渲染不参与力学布局，防止幽灵节点漂移）
- 孤儿：灰色节点（无任何连接）

两种异常直接在图上一眼可辨，配合 wiki_lint 可定位并修复（补链或删页）。

v4：UI

DSH Web 界面右侧边栏新增"知识库"标签（better-sidebar），无需离开对话即可浏览与管理知识库：

- 浏览：按分类（概念/实体/参考/综合/项目）分组的 vault 树；点击笔记 → 主区域打开"笔记"工作台标签（markdown 渲染 + wikilink 跳转 + frontmatter 信息）
- 搜索：顶部搜索框，回车检索（复用 v2 分层检索内核），结果带 snippet 与 confidence；可 ← 返回
- lint 徽标：显示页数与健康度（孤儿/断链/缺 frontmatter 计数），绿/琥珀/红三态
- 图谱：浏览/图谱切换，内嵌力导向交互图谱（复用 v3 图谱数据；点击节点打开笔记）
- 空态引导：vault 为空时提示"对 agent 说『把 XX 吸收进 wiki』开始"

后端提供 /api/obsidian-wiki/ 只读端点（pages / page / search / graph / lint），全部复用 v1-v3 内核（VaultStore / retrieve / buildGraph / lintVault），与 agent 工具同源。

v5：笔记编辑

v5 解决笔记工作台的四个体验缺口（富渲染 / 双链导航 / 源码视图 / 编辑保存）：

- 富渲染：markdown 管线升级为 marked 解析（含 wikilink 内联扩展，解析期直接产出锚点 token）+ DOMPurify 白名单净化（表格、引用块、任务列表、外链、分隔线全支持；代码块内的 [[x]] 按字面呈现）
- 双链原地导航：点击 [[wikilink]] 在当前工作台原地切页，带访问历史栈与「← 返回」按钮；目标不存在时提示断链且不离开当前页
- 源码视图：笔记页「预览 / 源码」切换；源码态展示磁盘原文（含 frontmatter，逐字节）+ 一键复制
- 全文编辑：源码态可直接编辑整份文件（含 frontmatter，可改 title/tags）并保存；保存走 POST /api/obsidian-wiki/page
- 保存安全：服务端校验路径合法性（防穿越）与 frontmatter 一致性（id/category 与目标不符即 422 拒绝，磁盘不动）；原子写（临时文件 + rename）；写端点仅接受同源请求（Origin/Referer 校验，跨站 403）+ 仅 JSON（415）
- 保存后联动：边栏树与 lint 徽标经 wiki:pages-changed 事件自动刷新

v6：增量构建

知识库的增量构建从「只能靠对话」升级为 UI 内一键完成：

- 一键重建索引：边栏「重建索引」→ POST /rebuild-index，从全部页面重生成 index.md（- [[id]] 标题 — 摘要 格式，retriever L1 零迁移兼容）。index.md 是派生工件——重建会覆盖手工注释，想保留的内容请写进页面本身
- 导入现有 md：边栏路径框（文件或目录）+ 分类选择 → POST /import。递归收集 .md（排除 node_modules/.git/target/dist，≤500 文件、单文件 ≤1MB、深度 ≤12）；已有合法 frontmatter 按声明原样入库，缺失的自动补全（id=文件名净化、title=首个标题、source=import:原路径）；id 冲突自动加 -2 后缀不覆盖；重导幂等（未变跳过、已变更新）；源文件只读
- lint 详情速修：lint 徽标点击展开面板——断链/孤儿页/缺 frontmatter 逐条可点；断链打开来源页（修链在来源页），其余打开对应页，直接进源码态修
- 会话蒸馏：随包分发 wiki-distill skill（内嵌 zstd 多帧会话提取器，首次运行落位 /_system/tools/，vault 已有则用 vault 版）；入口在边栏「知识蒸馏」分段（选项「近期会话蒸馏」，可选近 3/7/30 天），点击把触发指令预填进当前对话。原始会话归档写入 /_system/dsh-sessions/，不参与知识检索；流程：确认范围（默认近 3 天当前项目）→ 提取 → 按主题蒸馏 → wiki_ingest 入库（contentHash 增量，重复源自动跳过）
- 新端点安全：两个新写端点沿用 v5 模式（同源 403 / 非 JSON 415）；import 对源路径只读，写入落点经 SAFE_ID 净化 + vault 包含性双校验

v7：多 vault 管理

v7 解决「本地有几个库看不出来、没有切换/维护入口」：

- 当前库身份可见：边栏顶部「📚 库名 + 路径」常驻显示，一眼知道在看哪个库
- 库列表 + 切换：顶部下拉列出全部库（宿主工作区自动发现 + 显式挂接），附页数；切换即换当前库，边栏树/搜索/图谱与 agent 工具（wiki_ingest / wiki_query / …）全部跟随
- 新建/挂接/移除：⚙ 面板填目录（或「选目录」走宿主原生目录选择器）+ 显示名 → 新建/挂接；「×」移除仅限显式挂接的库（带确认，绝不删除磁盘文件；工作区/默认种子库只读）
- 跟工作区走：边栏挂载时按当前工作区自动激活对应库（客户端读取宿主工作区运行时；无该服务时降级为手动切换）；服务端启动时读宿主工作区注册表，自动发现各工作区的 .wiki
- 注册表：/knj-obsidian/vaults.json（可用插件配置 vaultRegistryFile 覆盖），损坏自动重建；vault 根不再写死宿主进程 cwd

新端点（写端点沿用同源 + JSON 校验）：

| 端点 | 说明 |
| GET /api/obsidian-wiki/vaults | 当前库 + 全部库（含只读 pageCount） |
| POST /api/obsidian-wiki/vault/activate | 按目录激活（已注册仅切换，未注册自动挂接） |
| POST /api/obsidian-wiki/vault/switch | 按 id 切换当前库 |
| POST /api/obsidian-wiki/vault/attach | 新建/挂接（目录不存在自动创建 + 脚手架 .wiki） |
| POST /api/obsidian-wiki/vault/remove | 从列表移除显式挂接的库（不删文件） |

v8：界面重设计（设计系统 v2）

v8 对 v4–v7 的 UI 做整体重设计，方向为宿主原生（native to DSH）：

- 宿主令牌驱动：所有颜色/字体/圆角/阴影改走宿主 --dsw-alias- / --dsw-static- / --dsw-font- 变量（src/client/styles.ts 一次注入，.knj-wiki 作用域隔离），随宿主浅/深主题自动适配，彻底移除硬编码色值
- 布局重组：重建/蒸馏/导入工具条收敛到底部「工具」面板；浏览/图谱改为分段切换；lint 收敛为底部状态条（页数 + 健康点 + 「问题」面板）
- 组件规范化：统一按钮（primary/subtle/ghost-danger）、输入框、选择器、chip、banner、空态/加载/错误态；全部补齐 hover / focus-visible / disabled 状态
- 图标集：emoji/文本符号（📚 ⚙ × ▲▼）替换为统一 SVG 线形图标（src/client/icons.tsx）
- 图谱：节点/边颜色改走宿主令牌（浅/深主题均可读），新增统计与分类图例
- 笔记工作台：标题层级、元信息 chip、分段切换、markdown 排版（标题/引用/表格/代码/任务列表）按宿主字体阶梯对齐

v9：代码结构采集（GUI 启动器 + wiki-collect skill）

v9 把「本地工程代码 → 知识页」做成 agent 会话驱动的采集：GUI 只当启动器，把触发指令交给当前对话的 Agent，由内置 wiki-collect skill 完成扫描 → 联动存量对账 → 蒸馏 → 直接入库（用户决策：不做二次确认；知识库纳入 git 分支合并把关已预留，暂未实现）。

- 内置 wiki-collect skill（wiki-collect/SKILL.md，随包分发）：用 wiki_mine 扫描枚举/常量（→ dictionaries）与 SQL DDL/MyBatis/JPA 表结构（→ tables）并对账存量知识（new/changed/unchanged/deleted + 同名近似页提醒），蒸馏后经 wiki_ingest 直接入库（contentHash 增量跳过、未知/推断保持 unknown/inferred、不覆盖他源页面、不读会话归档）
- GUI 启动器（知识蒸馏）：边栏「知识库」→「知识蒸馏」分段——五个选项：枚举/常量字典、表结构、系统功能挖掘（预留位：将由 3 个 skill 组合完成——代码结构 → 关系/调用 → 功能聚合，本机暂未安装；选中时标注「预留」并禁用动作，不生成会失败的指令；需要字典 + 表结构时可分别选前两项各跑一次）、近期会话蒸馏（可选近 3/7/30 天）、指定会话蒸馏（复选一个或多个会话）。点「新建会话并预填」——插件会新建一个会话（cwd = 当前库根目录）并切过去，把触发指令预填进新会话的输入框（可见可编辑，回车即发送给 Agent），不会打扰你当前正在聊的会话；宿主不支持新建会话时退化为「复制触发指令」自行粘贴。
代码侧走 wiki-collect，会话侧走 wiki-distill
- 指定会话蒸馏：会话列表默认收起，展开后可搜索过滤、限高滚动、一键全选当前结果，已选 id 常驻显示并可清空；列表不可用时退化为粘贴 session id（逗号分隔多个）。提取器新增第 6 参数按会话 id 过滤（sessionIncluded，逗号分隔可多个），指令显式把时间下限设为 1970-01-01T00:00:00Z 以忽略 mtime 过滤（否则老会话会被漏掉），入库 source=session: + contentHash 去重；提取器自测已纳入主套件（wiki-distill-extractor.test.mjs 包装 wiki-distill/extract-dsh-sessions.test.cjs）
- 会话蒸馏并入同一入口：近期会话蒸馏由「当前工作区 + 时间范围」驱动（原有 wiki-distill skill 与提取器不动）；底部「工具」面板不再保留重复的复制式蒸馏按钮
- 诚实范围披露：支持 Java enum、Java public static final、SQL DDL、MyBatis XML、JPA Entity；不支持 TypeScript / Python / Go / 任意 ORM / JSON Schema（UI 与 skill 均写明）；会话侧声明原始归档只写入 /_system/dsh-sessions/、不读其他工作区会话、不参与检索
- 授权模型：GUI 点击 = 显式触发（= 授权）；skill 内部直接入库，不设中间草稿/确认状态机；报告在会话中可见，用户可随时打断；未来 git 分支合并作为写入把关（预留扩展位，未实现）
- 快速导入（直接写入）：底部「工具」面板的 md 导入保留 API 兼容，UI 标注为「快速导入（直接写入）——跳过受审阅流程与哈希校验」，为高级路径

v10：初始化知识库（工作区无库时）

v10 解决「工作区里还没有知识库」的场景，并纠正一个误导：注册 ≠ 建库。

- 新增 agent 工具 wiki_init：为当前库创建 .wiki 脚手架（index.md、.manifest.json、 concepts/entities/references/synthesis/projects/dictionaries/tables 七个目录），幂等（已存在时 created=false 且只补缺失结构），返回 root / wikiRoot / created / pageCount；只接受当前库或已注册库根目录，其他路径报错并提示先在边栏新建/挂接
- GUI 初始化入口（触发 agent）：当前库未初始化时，边栏身份区显示「未初始化」徽标 + 「初始化知识库」按钮，启动器也给出同款引导；点击会新建会话并把初始化指令预填进该新会话（复制兜底），由 Agent 调 wiki_init 建库并回报路径——GUI 自身不写盘
- 取消静默建库：/vault/activate（跟随工作区）改为只登记 + 切换当前库，不再自动创建 .wiki；建库只发生在显式动作：wiki_init、显式 attach（新建/挂接），或首次真实写入（写入必须建目录）
- 库列表暴露 initialized：GET /vaults 每个库返回 initialized（磁盘是否已有 .wiki），于是 Documents、profiles/web 这类「有登记、无目录」的幽灵库会被如实标为未初始化，而不是看起来像一个空库
- 内置 wiki-init skill（wiki-init/SKILL.md，随包分发）：初始化流程与边界说明（只建结构、不采集不写页；结构以插件为准——没有 _raw/、.obsidian/、.env，那是另一套 obsidian-wiki 项目）

v12：还原点与批次质量凭证（对抗审查后加固）

v12 按对抗审查结论给「知识蒸馏」补上可回滚与可评估能力，并修掉若干真实缺陷：

- 还原点（checkpoint）：新增 agent 工具 wiki_checkpoint / wiki_checkpoints 与路由 GET /checkpoints、POST /checkpoint/restore；快照落在 .wiki/_system/checkpoints// （七分类页面 + index.md + .manifest.json）。蒸馏批次必须先建还原点，质量不佳时在「知识蒸馏 → 还原点」一键整库回滚（快照后新增/修改的页面会随之回退）。
还原点 id 有严格格式校验，拒绝路径穿越（../ 之类的 id 直接 400）。
- 批次纪律（写入指令内置，skill 同步）：① 建还原点 → ② 先用 wiki_query 查重（已有同主题页就更新而不是新建，防 -2 堆积）→ ③ 写前先列清单（将创建/更新哪些页，等确认再写）→ ④ wiki_ingest → ⑤ 质量评估报告（还原点 id、逐页 id/category/confidence/新增 wikilink 数、查重决策、孤儿与推断占比风险）。
- 幂等修正：会话蒸馏的 contentHash 改为逐会话摘要哈希（原用 catalog.json 整体哈希，滑动窗口每天变会重蒸旧会话）；source 改为 session: 或稳定主题 slug，禁止日期区间 source（那会把更新变成新建 -2）。
- 工作区硬约束：project-filter（--D-workspace-xxx--）与 sessions 根由插件算好写进指令， agent 不再自行推导；切换知识库时启动器刷新并清空旧库的会话选择。
- 只读路径零写副作用：wiki_query / wiki_lint / wiki_checkpoints 改用 currentReadonly()， /vault/、/checkpoints 等非写页端点不再 ensure()——不再出现“查询即建库”。
- 索引自动重建：wiki_ingest 写完立即重建 index.md（派生工件），L1 检索不再滞后。
- 原子写：writePage 与 manifest 落盘改为 tmp+rename；新增合并写 updateManifestMerged，降低崩溃/多进程共用库导致的半截文件与条目丢失。
- 图谱配色补全：dictionaries / tables 两类在 graph.html 有独立颜色与图例（此前与默认灰同色、图例缺失）。
- 检索修复：L1 index-only 检索补齐 dictionaries / tables 两类（此前会漏掉字典与表结构页）。
- 导入边界：POST /import 只允许导入已注册库根目录内的 Markdown（库外路径 400），避免同源脚本借导入把任意目录的 .md 拉进可检索知识库。
- 会话过滤更严：提取器会话过滤改为「精确或前缀匹配」（不再是任意子串），避免片段误命中无关会话； skill 要求逐字节比对提取器版本，版本不一致时用 skill 版本覆盖（否则“指定会话蒸馏”会退化成整范围）。
- 预填不覆盖用户输入：新建会话预填的重试循环在检测到用户已开始输入时立即停手。
- wiki_init 去掉无意义参数：只初始化当前库（原 root 参数必然报错）。

- Obsidian 适配：ensure() 会写 .wiki/.obsidian/app.json 的 userIgnoreFilters，排除 _system/、_raw/、wiki-export/、.manifest.json —— 把 .wiki 直接当 Obsidian vault 打开时，会话归档与派生工件不再进搜索/图谱；已有 app.json 只做并集合并，不覆盖用户自定义。
- 单一写入授权规则（消除此前自相矛盾）：授权 = 用户显式触发（点启动器 / 对话里明确要求）；入库前必做还原点 + 输出写前清单（信息性预览：列完即继续，不阻塞等待确认）；写后必做质量评估报告；把关 = 还原点一键回滚 + 报告 + 将来的 git 分支合并。启动器与 wiki-collect / wiki-distill 三方表述一致，且由 knowledge-distill.test.mjs 断言（禁止再出现“等确认”式措辞）。
- 内部状态豁免与知识面隔离：还原点 / 挖掘进度 / 会话归档存放于 _system/（可经专用工具与路由枚举），但不得出现在 pages / 检索 / 图谱 / 图谱导出 / index.md；会话蒸馏读取 .zstd 归档属明确豁免（只读输入，产物仍是 Markdown 知识页）。integrity.test.mjs 覆盖：跨源不覆盖 + 同源 -N 复用、页面原子写无 tmp 残留、L1 index-only 覆盖 dictionaries/tables、_system 不进任何知识面。

路线

- 检索 ✅ 已上线：wiki_query 工具 + wiki-query skill 双通道分层检索
- 图谱 ✅ 已上线：wiki_export 工具导出交互图谱（graph.html）与结构化数据（graph.json）
- UI ✅ 已上线：右侧边栏"知识库"标签 + 笔记/图谱工作台（v4）
- 编辑 ✅ 已上线：富渲染 + 双链导航 + 源码视图 + 全文编辑（v5）
- 历史会话挖掘 ✅ 已上线：wiki-distill skill + 边栏蒸馏按钮（v6）
- vault 跟随项目 ✅ 已上线：多库管理 + 跟随工作区（v7）——当前库身份、库列表/切换、新建/挂接/移除、注册表持久化
- 知识蒸馏 ✅ 已上线：边栏「知识蒸馏」统一启动器（v9/v10/v11）——枚举/常量字典、表结构、全部、近期会话蒸馏（近 3/7/30 天）、指定会话蒸馏（复选）；点击新建会话并预填 → agent 用 wiki-collect / wiki-distill 入库
- 初始化知识库 ✅ 已上线：wiki_init 工具 + wiki-init skill + GUI 初始化入口（v10）——无库工作区显式初始化，取消静默建库

开发

npm run check # typecheck + build（服务端）
npm run check:client && npm run build:client # 客户端类型检查 + bundle
node --test *.test.mjs # 全部测试（191 例；含 collection-client 启动器契约与 vault-init 初始化契约）
已知基线：wiki_ingest 的 relatedCheck 输出是 master 工作树中尚未收尾的 WIP（src/tools.ts 已新增输出但 ingest-delta.test.mjs / tools.test.mjs 断言未同步），与 v9/v10 功能无关；相关 8 例在 master 原工作树同样失败。

许可证

MIT — 见 LICENSE。