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科研工作台 yzlin286-wq/Deepscient

DeepSeek Harness
yzlin286-wq6 天前有提交已提供中文文档扫描:无法判定

让 AI 与人类一起攻克真正的科学难题 —— 12 阶段 55 门 · 36 工具 · 98 条技能 · 证据链与可复现

50/100
综合分
50
GitHub 星标
—
npm 周下载
—/5
用户评分

数据截至 2026/10/26 · 周下载取自 npm 全网(含 CI / 镜像),非本站安装数;综合分由星标、活跃度与兼容性检查合成。

该插件未发布到 npm,按作者文档从 GitHub 源安装即可(静态检查只覆盖 npm 路径,不代表插件不可用)。
安装命令 · 需先装 dsh CLI 引擎
dsh plugin --profile web add yzlin286-wq/Deepscient
该包不可直接 npm 安装,改从 GitHub 源安装(明细见下方安装检查)

状态速览

判定依据:实装验证 · 静态安装检查 · 自动扫描 · 仓库维护状态
信任档位:需留意
是什么
dsh 原生插件 · skill
装得上吗
实装验证未通过(unknown),装前请到仓库确认最近更新与 issue
L4 · 真实安装等级说明 →
安全吗
本站尚未对该插件做风险分级
暂未覆盖,不等同于无风险
还在维护吗
活跃:最近一次提交在 6 天前
档位由哪些信号合成

本站实装验证(真实安装 L4 覆盖全站;L5 为运行时冒烟或实机截图,覆盖范围小于 L4) · 验证所用 dsh 版本 · 静态安装检查 · 风险分级 · 仓库维护状态。 下方各区块是它的证据明细。

验证判据与等级说明 →
⚠︎ 实装验证未通过(unknown · 2026/10/23) ——可能是验证环境差异,装前建议到 GitHub 仓库确认最近更新与 issue。
社区实装还没有人打卡 · 装过的第一个就是你
安装兼容性检查需源码安装

仓库 package.json 标记 private,未发布到 npm,需从源码安装;安装清单取自 deepscient/package.json

展开查看检查明细 ↓

以下结论由程序自动检查 npm 包、engines 声明与入口文件得出,未做人工实机验证——能装不等于用着没问题。

✗npm 包@local/deepscient(未发布到 npm,仅可源码安装)
✓Node 引擎未声明 engines.node
✓dsh CLI 依赖未声明 dsh 版本约束
✓入口文件main/exports/bin 已声明

源码安装时若 pnpm 拦截 prepare 脚本,按其提示在 pnpm-workspace.yaml 的 allowBuilds 中放行后重跑。

验证方式:npm registry 存在性 + package.json 静态校验 · 最后检查 2026/10/31 19:55:55

安全扫描自动 · 静态分析源码
v2.7.0
⚪ 扫描:无法判定尚无人工评估
展开查看扫描说明与证据 ↓

已尝试扫描但取不到可分析的源码:仓库或包不存在、已删除,或为非 JS/TS 实现、未随包发布源码。无法判定,不代表安全。

  • · 取源不可用(Error: 仓库体积 226.5MB 超过扫描上限 200MB(避免单条拖垮整轮))
扫描于 2026/10/31(0 天前)

静态扫描只反映源码中出现的调用,不构成安全背书;人工评估与自动扫描相互独立、互不覆盖。

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README

由 DeepSeek 最新模型翻译生成
DeepScient 让 AI 与人类一起攻克真正的科学难题。 DeepScient 是一个科研工作台,跑在 DeepSeek Harness(dsh)运行时上:它把「选题 → 检索 → 实验 → 分析 → 作图 → 写作 → 投稿 → 审稿回应」拆成看得见的 12 个阶段、 55 个可判定的门,配上 36 个科研工具、98 条技能和一套可审计的证据链。 它不是聊天框套壳,也不是论文生成器。它坚持三件事: - 证据链:每条结论都要能追到数据,数据要能追到能重跑的实验;science_ 工具里没有「编一个数」的出口。 - 可复现:实验记录、环境、版本、随机种子都落盘,换台机器能重跑出同样的表。 - 人保留判断权:凡是系统算不出来的(构念效度、创新性、伦理取舍),工具只给检查清单,不替你下结论。 桌面版(Windows) 不想折腾环境:下载自包含安装包,解压即用——不需要 clone 仓库,也不需要单独安装 DeepSeek Harness。 1. 下载 DeepScient-desktop-v0.12.0.zip(约 635 MB); 2. 解压到短路径(如 D:\DeepScient,不要放在很深的目录里); 3. 双击根目录 DeepScient 启动.cmd。
展开完整文档(README 剩余 1 节)
DeepScient

让 AI 与人类一起攻克真正的科学难题。

DeepScient 是一个科研工作台,跑在 DeepSeek Harness(dsh)运行时上:它把「选题 → 检索 → 实验 → 分析 → 作图 → 写作 → 投稿 → 审稿回应」拆成看得见的 12 个阶段、 55 个可判定的门,配上 36 个科研工具、98 条技能和一套可审计的证据链。

它不是聊天框套壳,也不是论文生成器。它坚持三件事:

- 证据链:每条结论都要能追到数据,数据要能追到能重跑的实验;science_ 工具里没有「编一个数」的出口。
- 可复现:实验记录、环境、版本、随机种子都落盘,换台机器能重跑出同样的表。
- 人保留判断权:凡是系统算不出来的(构念效度、创新性、伦理取舍),工具只给检查清单,不替你下结论。

桌面版(Windows)

不想折腾环境:下载自包含安装包,解压即用——不需要 clone 仓库,也不需要单独安装 DeepSeek Harness。

1. 下载 DeepScient-desktop-v0.12.0.zip(约 635 MB);
2. 解压到短路径(如 D:\DeepScient,不要放在很深的目录里);
3. 双击根目录 DeepScient 启动.cmd。首启自动装配桌面 profile(实测约 30–40 秒),点「登录 DeepScient」在浏览器完成授权即进入工作台。

安装包内含 deepscient 0.12.0 与 dsh-science 0.5.0,带调度层(M7):5 个工具(science_org_chart、science_campaign_plan、science_campaign_run、science_campaign_status、science_campaign_report)与 4 级 13 岗编制。数据写在 %USERPROFILE%\.deepscient,不写 ~/.dsh。

从源码构建(开发者形态,复用本机已装的 DeepSeek Harness 桌面壳):

git clone https://github.com/yzlin286-wq/Deepscient.git
cd Deepscient
powershell -File deepscient/desktop/assemble-profile.ps1 # 装配 ~/.deepscient/profiles/desktop powershell -File deepscient/desktop/build-desktop.ps1 # 派生独立应用(约 1.5 GB) powershell -File deepscient/desktop/deepscient-desktop.ps1 -CreateShortcuts

- 完整步骤、登录流程、数据隔离与常见问题见 docs/desktop-install.md;
- 桌面版额外带三个本地科学计算工具:local_compute_devices(CUDA → MPS → CPU 后端探测)、local_numeric(numpy/scipy)、local_symbolic(sympy)。

桌面版(macOS)

Apple Silicon 用户:下载自包含安装包,拖进「应用程序」即用——不需要 Node.js、pnpm,也不需要单独安装 DeepSeek Harness。

1. 下载 DeepScient-0.12.0-mac-arm64.dmg(479 MB;同页也有 499 MB 的 .zip);
2. 挂载后把 DeepScient.app 拖进 Applications;
3. 首次打开会被 Gatekeeper 拦一次(未签名构建):右键 →「打开」→「打开」,或执行 xattr -dr com.apple.quarantine /Applications/DeepScient.app;
4. 打开后首启自动装配桌面 profile(约 30–60 秒),点「登录 DeepScient」在浏览器完成授权即进入工作台。

数据同样写在 ~/.deepscient,与 Windows 版共用同一套课题结构,不写 ~/.dsh。

从源码构建(macOS 桌面壳由 deepseek-harness 源码构建,再派生应用):

git clone https://github.com/yzlin286-wq/Deepscient.git
cd Deepscient
bash deepscient/desktop/build-desktop.sh --shell "/path/to/DeepSeek Harness.app"
bash deepscient/desktop/assemble-profile.sh
bash deepscient/desktop/deepscient-desktop.sh

- 完整安装、Gatekeeper、日志、卸载与排错见 docs/desktop-install-macos.md;
- macOS 构建链(官方壳源码构建、helper 改名、asar 解包、ad-hoc 重签)见 deepscient/desktop/README-macos.md。

它长什么样

┌─────────────────────────────────────────────────┐
│ DeepScient 工作台(deepscient/) │ │ 12 阶段 · 55 门 · 课题库 · 计费 · 引导 · 设置 │ └──────────────┬──────────────────────────────────┘ │ 同一个 dsh 运行时,独立数据根/profile/端口 ┌──────────────┴──────────────────────────────────┐ │ 科研后端(dsh-science/) │ │ 36 工具 · 55 门学科数据 · 12 阶段流程定义 │ │ 证据链 / 统计 / 作图 / 写作 / 审稿 / 前沿扫描 │ └──────────────┬──────────────────────────────────┘ │ 技能与外部工具 ┌──────────────┴──────────────────────────────────┐ │ 98 条技能(随包 17 + 第三方 81) │ │ MCP 工具层(可选,papers 23 + pubmed 11) │ └─────────────────────────────────────────────────┘

两个包各自独立、可分开用:

| 包 | 版本 | 作用 | 依赖 |
| deepscient/ | 0.12.0 | 产品壳:启动器、Host API、Web 界面、调度层、技能与 MCP 装配、验收脚本 | dsh 运行时 + dsh-science |
| dsh-science/ | 0.5.0 | 科研内核:工具、学科数据、流程定义、preset、调度(orchestra) | 只需 dsh(@deepseek-ai/cordis) |

快速开始

前置:Windows 10/11、Node ≥ 22.5、已装 DeepSeek Harness 桌面版。

git clone https://github.com/yzlin286-wq/Deepscient.git
cd Deepscient

1) 把科研后端挂进一个独立 profile(只需一次)在 dsh 会话里执行: plugin_manager install_bundle <仓库根>\dsh-science 或打开 dsh 的 Plugins 页,安装本目录下的 dsh-science/

2) 从你现有 dsh profile 抽供应商层(不含密钥,只抽 apiKeyEnv 这类变量名)
node scripts/deepscient-sync-models.mjs

3) 起实例 deepscient\bin\deepscient.cmd

浏览器会自动打开 http://127.0.0.1:3081(端口占用则顺延 3082–3099)。首次打开有六步引导,见 docs/guide.md。

可选:

装 81 条第三方科研技能(联网一次,pin 到 commit,可校验可卸载)
node deepscient/scripts/install-skills.mjs --plan # 先看会装什么
node deepscient/scripts/install-skills.mjs --apply # 真装

开 MCP 工具层(多源文献检索 + PubMed 全文) $env:DSH_ENABLE_MCP = '1' deepscient\bin\deepscient.cmd

它能做什么

| 能力 | 规模 | 说明 |
| 流程 | 12 阶段 / 55 门 | 每道门对着库里的真实状态判定,不是让模型「觉得可以了」 |
| 工具 | 36 个 | 23 个挂在具体阶段,13 个跨阶段(查历史、溯源、教练、期刊情报、前沿扫描) |
| 学科 | 55 门 | 每门的方法、统计口径、报告规范、常见坑 |
| 技能 | 98 条 | 随包 17 条 + 第三方 81 条(8 个 MIT 仓库,pin 到 commit) |
| 文献源 | 8 个内置 + 自定义 | Crossref / OpenAlex / arXiv / PubMed / Semantic Scholar / Europe PMC 等 |
| MCP | 34 个工具(可选) | papers 23 个多源检索下载 + pubmed 11 个全文与 MeSH |
| 期刊情报 | 5000+ 刊 | 分区、周期、格式、投稿要求,用于选刊与排版 |

界面里有五个页签:工作台(阶段与门)、课题库、接入(数据源与凭据)、 计费(token 真值 + 按你填的价目估算)、说明(这套东西怎么用、边界在哪)。

仓库结构

.
├─ README.md ← 你在这里 ├─ LICENSE MIT ├─ CHANGELOG.md 0.1.0 → 0.4.0 ├─ CONTRIBUTING.md 怎么改、怎么验、什么不能提交 ├─ ROADMAP.md 已知边界与后续计划 ├─ docs/ │ ├─ README.md 文档总索引(两张包各自的 docs 都在这张表里) │ ├─ spec.md 技术规格:实例形态、组合、验收口径 │ └─ third-party.md 81 条第三方技能的来源、许可与署名 ├─ deepscient/ 产品壳(0.12.0) │ ├─ bin/ 启动器(PowerShell,必须带 BOM) │ ├─ host/ Host API:/health /skills /presets /projects …
│ ├─ client/ 界面 │ ├─ docs/ 9 篇使用文档 │ ├─ scripts/ 验收与技能安装(零依赖) │ ├─ cordis.patch.yml 组合层 │ └─ mcp.patch.yml MCP 层(默认不加载) ├─ dsh-science/ 科研内核(0.5.0) │ ├─ lib/ 工具注册与流程引擎(ESM) │ ├─ data/ 55 门学科、统计口径、期刊情报、流程定义 │ ├─ presets/ 科研模式 preset │ ├─ skills/ 随包 17 条技能 │ ├─ skills-vendor/ 第三方技能清单(只有 manifest,没有正文) │ └─ docs/ 7 篇方法论文档 ├─ scripts/ 供应商层抽取脚本 ├─ tools/ 仓库级工具(打包面校验、发布) └─ .github/ CI、Issue/PR 模板、安全策略

怎么验它真的能用

这个仓库的规矩是:声称的每一件事都要有一条能跑的命令对上。
powershell

打包面(零依赖,CI 与本地同一份):语法、files 完整性、清单 pin、.ps1 BOM、隐私、文档链接

node tools/verify-packaging.mjs

活实例验收(需要实例在跑):294 项 HTTP/文件断言

node deepscient/scripts/verify-deepscient.mjs --token <本次启动的 token>

端到端:真 key 真模型真回答 + 建课题 + 预设体检 + 技能与 MCP 装配

node deepscient/scripts/e2e-science-run.mjs --run --base http://127.0.0.1:3081

第三方技能安装器自检(10 项)与干跑

node deepscient/scripts/install-skills.mjs --self-test
node deepscient/scripts/install-skills.mjs --plan

运行时面的便携性检查(78 个文件:无提示词变量、无本机路径、无私有插件痕迹)

node dsh-science/scripts/verify-portability.mjs

MCP 服务器单独握手(绕开 dsh,出错时把 npx 的报错打出来)

node deepscient/scripts/probe-mcp.mjs pubmed

最近一次全绿记录:打包面 20 项、活实例 294 项(不带 token 285 项)、端到端六段 PASS、技能清单 81/81 pin 正确、MCP 开启后注册 34 个工具。

已知边界

诚实列在这里,也写在 ROADMAP.md:

- headless 不组合 agent preset,所以「会话里看到几条技能」只能在 Web 会话里验,不能从命令行验。
- MCP 只验到「工具已注册」,还没有一次「让模型真的调 mcp__pubmed__ 查到一篇」的完整往返记录。
- 界面没做截图回归:改动后靠人工看一眼,没有像素级基线。
- 只在 Windows 上验证过。启动器是 PowerShell,bin/launch.ps1 依赖 BOM;Linux/macOS 需要另写启动器。

路线图

见 ROADMAP.md。近期三条:巨型技能包的折叠路由、MCP 真实调用链、界面截图基线。

许可与致谢

本仓库代码 MIT,见 LICENSE。

第三方技能各自沿用来时许可(全部 MIT 系),清单与署名见 docs/third-party.md——包括 K-Dense-AI/scientific-agent-skills(42 条)、 Aperivue/medsci-skills(20 条)、 jxtse/scientific-research-skills(7 条)等 8 个仓库。
它们的正文不进本仓库,装的时候按 commit 拉取并校验 sha256。

运行在 DeepSeek Harness 之上:组合层、preset、Host API、Web 界面全部复用它的插件体系。
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让 AI 与人类一起攻克真正的科学难题 —— 12 阶段 55 门 · 36 工具 · 98 条技能 · 证据链与可复现

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